갑상선호르몬의 변화, 즉 과잉 혹은 결핍은 성기능에 영향을 미쳐 성생활에 장애를 초래합니다. 갑상선 기능항진증과 갑상선 기능저하증 모두 성기능을 떨어드리며 성욕을 감퇴시킵니다. 특히 갑상선 기능항진증에서 더 현저한데 남자의 경우 발기가 잘 안되며 성욕이 없어 부부생활에 지장을 받습니다. 그러나 이러한 현상은 일시적인 것으로 갑상선 기능항진증을 치료하면 자연적으로 회복되므로 걱정할 필요가 없습니다. 많은 환자들이 정력을 보강하기 위해서 민간 요법에 많은 경비를 낭비하는데 이는 백해무익한 일입니다. 갑상선질환에서의 성기능 감퇴는 갑상선호르몬의 변화에 따른 일시적이고 이차적인 현상이므로 갑상선질환을 치료하면 자연적으로 해소됩니다. 여자 환자에서는 갑상선 기능 이상에 의해 성기능의 감퇴뿐만 아니라 월경불순이 초래됩니다. 갑상선 기능항진증에서는 월경의 양이 줄거나 혹은 월경이 중단되기도 하며 반대로 갑상선 기능저하증에서는 월경의 양이 많아지고 월경하는 날짜도 길어집니다. 이러한 월경불순 때문에 산부인과를 찾는 경우가 많은데 이는 갑상선 기능변화에 따른 이차적인 현상이므로 갑상선질환을 치료하면 자연적으로 정상화됩니다.