모든 질병의 치료는 그 원인을 제거하는데 있습니다. 갑상선 기능항진증은 자가 면역질환으로 자가항체가 갑상선을 자극하여 발생되는 질환이므로 원칙적으로 자가 항체를 제거하거나 또는 자가항체의 생성을 억제시키면 근본적인 치료가 가능하리라고 봅니다. 그러나 불행히도 현재로서 그와 같은 치료법은 없습니다. 갑상선 기능항진증은 갑상선호르몬의 과잉 분비에 의한 임상소견이므로, 갑상선 호르몬의 분비를 정상화시키면 비록 근본적인 치료는 아닐지라도 모든 임상 증상을 없앨 수 있으므로 치료가 가능합니다, 따라서 이러한 목적으로 갑상선 호르몬의 합성 과정을 억제하는 약물을 투여하거나, 호르몬의 생산 장소인 갑상선 조직을 파괴 또는 제거시키는 방법 등이 활용되고 있습니다.